信息工程學院最早可追溯到建院初期1979年學校創立的電子工程系。現信息工程學院由原電子信息工程學院、原自動化學院自動控制系、電工電子技術教研部（電工電子實驗中心）、原計算機學院計算機科學與技術系、網絡工程系、教育技術系、計算機文化基礎教研部合并組建而成。學院目前共有135名專任教師，教授14人，副教授49人，博士學位65人，博士生導師3人，國家二級教授4人，碩士生導師51人，行業導師59人，享受政府特殊津貼專家5人，首批入選“贛鄱英才555工程”專家2人。全國優秀教師1名，江西省教學名師2人，江西省青年科學家1名，江西省中青年學科帶頭人6人，江西省優勢科技創新團隊帶頭人1人，江西省中青年骨干教師7人，江西省新世紀“百千萬人才工程”人選3人，江西省杰出青年基金獲得者2人，青年井岡學者2人，省“雙千計劃”入選1人，“贛鄱俊才”高校青年領軍人才1人。學院現有在冊本科生2894人，全日制研究生387人。

學院現有“電子信息工程”、“通信工程”、“自動化”、“計算機科學與技術”、“網絡工程”、“電氣工程及其自動化”、“人工智能”7個本科專業，其中“自動化”、“電子信息工程”、“計算機科學與技術”專業，先后入選國家級一流本科專業建設點，“自動化”、“電子信息工程”專業已通過工程教育認證。“電氣工程及其自動化”專業即將進校考查、“通信工程”專業工程教育認證申請獲得受理。“電子信息工程”專業2002年獲首批江西省品牌專業，2008年獲國家特色專業，2017年中國大學本科教育專業競爭力排行被評為4星級專業，2019年獲批江西省一流特色專業，2023年正式通過工程教育認證；“自動化”專業2004年獲批江西省品牌專業，2010年獲批江西省特色專業，2013年入選教育部卓越工程師教育培養計劃，2022年正式通過工程教育認證；“計算機科學與技術”專業2004年獲批江西省品牌專業，2008年獲批江西省特色專業，2013年獲批江西省專業綜合改革試點專業，2017年獲批江西省高校一流本科專業建設點。“網絡工程”專業2019年獲批江西省一流本科專業建設點，并評為4星級專業，2022年獲批江西省普通高等學校五星級本科專業。“單片機與嵌入式系統實驗中心”2006年獲批江西省高校實驗教學示范中心，“電工電子實驗中心”2007年獲批江西省高校實驗教學示范中心。

學院現有“控制科學與工程”、“計算機科學與技術”、“信息與通信工程”3個一級學科碩士學位授權點，擁有計算機應用技術、控制理論與控制工程、檢測技術與自動化裝置、模式識別與智能系統、導航制導與控制、通信與信息系統、信號與信息處理7個二級學科碩士點，擁有“電子信息”（包括“電子與通信工程”、“計算機技術”、“控制工程”三個研究方向）和“交通運輸”（“交通信息與控制工程”研究方向）兩個工程碩士專業學位授權點。其中，“控制理論與控制工程”和“計算機應用技術”為江西省“十一五”重點學科，“計算機科學與技術”為江西省“十二五”重點學科。

學院目前擁有江西省圖像處理與模式識別重點實驗室、江西省智能視覺與自動化裝置工程研究中心、江西省撫州市數字化轉型促進中心三個省級科研平臺，擁有南昌航空大學計算機視覺研究所、空間信息處理研究所等科研平臺，2022年，依托學院成立了南昌航空大學數字經濟研究院，進一步將學院科研平臺提升到新的發展層次。學院設有工業檢測與自動化技術，光纖傳感與通信技術，圖形圖像處理與軟件技術，無線通信技術，分布式系統及數據挖掘，計算機網絡與數據庫應用技術，計算機控制與智能系統，智能信息處理，先進控制理論及其應用，模式識別與圖像處理，導航、制導與控制等研究方向。學院始終聚焦航空產業、地方支柱產業、高新技術產業，堅持“基礎研究上水平、應用研究出效益”的科研方針。近年來科研項目、科研獎勵、學術論文數量不斷增加，科研經費逐年提升，不斷獲得歷史性突破。先后獲江西省自然科學一等獎、二等獎各1項，江西省科學進步一等獎、二等獎、三等獎各1項，江西省技術發明一等獎、二等獎各1項，承擔國家級科研課題50余項，企業橫向課題100余項。學院致力于為服務航空國防工業和地方經濟建設作出更大貢獻。

學院積極推進“全員、全過程、全方位”的三全育人體系建設，堅持強化黨建引領學風建設，促進學院形成良好學風，學院鼓勵學生積極參加課外科技創新活動，鍛煉學生的動手能力，形成“強基礎、重牽引、促提升”的學生科創和人才培養有效運行機制。近年來共獲國家級競賽獎項近百項，本科生科技創新能力居江西省前列。榮獲多個國家級賽事全國最高獎，分別為全國大學生智能汽車競賽一等獎、全國電子設計大賽一等獎、“西門子”中國智能制造挑戰賽特等獎、藍橋杯軟件和信息技術專業人才大賽全國總決賽一等獎。研究生先后獲江西省優秀碩士學位論文三十余篇；獲批江西省學位與研究生教育教改課題、江西省研究生優質課程、江西省研究生創新專項基等近百項（門）。在“華為杯”中國研究生數學建模競賽、江西省研究生數學建模競賽、全國大學生英語競賽、“西門子杯”中國智能制造挑戰賽、“兆易創新杯”中國研究生電子設計競賽等各類國家級、省級競賽中屢獲佳績。畢業生受到社會的廣泛認可和普遍贊譽。