園藝與植物保護學(xué)院組建于2018年，學(xué)院歷史可追溯到 1952年。新中國成立不久，在黨中央親切關(guān)懷下，國家抽調(diào)北京農(nóng)業(yè)大學(xué)、河北農(nóng)學(xué)院、山西農(nóng)學(xué)院等院校優(yōu)秀教師支援內(nèi)蒙古建設(shè)，組建內(nèi)蒙古畜牧獸醫(yī)學(xué)院，同時開始籌備蔬菜學(xué)、果樹學(xué)和植物保護學(xué)等專業(yè)。1958年開始招收植物保護、果蔬等本科專業(yè)。

目前，擁有園藝學(xué)和植物保護學(xué)2個一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點，農(nóng)藝與種業(yè)和資源利用與植物保護2個專業(yè)學(xué)位授權(quán)點。學(xué)院現(xiàn)有園藝學(xué)1個自治區(qū)級“雙一流建設(shè)學(xué)科”；蔬菜學(xué)和果樹學(xué) 2 個自治區(qū)級重點學(xué)科和農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治 1 個自治區(qū)級重點培育學(xué)科。擁有“內(nèi)蒙古自治區(qū)野生特有蔬菜種質(zhì)資源與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室”、“生物農(nóng)藥創(chuàng)制與資源利用自治區(qū)高等學(xué)校重點實驗室”（培育建設(shè)）、“內(nèi)蒙古自治區(qū)設(shè)施園藝工程技術(shù)研究中心”和“內(nèi)蒙古自治區(qū)寒旱區(qū)作物保護工程技術(shù)研究中心” 4 個省級科學(xué)研究平臺，1個國家級中職教師設(shè)施農(nóng)業(yè)生產(chǎn)技術(shù)培訓(xùn)基地，1個中蒙俄設(shè)施園藝產(chǎn)業(yè)科技創(chuàng)新研究院；建有“作物土傳病害微生態(tài)調(diào)控院士工作站”和“草原昆蟲研究中心”（與中國科學(xué)院共建）。

學(xué)院現(xiàn)開設(shè)園藝（國家級一流專業(yè)建設(shè)點、自治區(qū)級品牌專業(yè)）、植物保護（國家級一流專業(yè)建設(shè)點，自治區(qū)級品牌專業(yè)）和設(shè)施農(nóng)業(yè)科學(xué)與工程3個本科專業(yè)?，F(xiàn)有教職工71人，其中教授21人，副教授17人，高級實驗師3人；博士生導(dǎo)師16人，碩士生導(dǎo)師33人，已取得博士學(xué)位教師50人；現(xiàn)有特聘院士2人(中國科學(xué)院院士和荷蘭皇家科學(xué)院院士各1名)，全國優(yōu)秀農(nóng)業(yè)科技工作者1人，自治區(qū)有突出貢獻的中青年專家1人，自治區(qū)新世紀(jì)“321”人才工程10人，自治區(qū)教育廳“111”人才工程3人，自治區(qū)“草原英才”7人，自治區(qū)“草原英才”團隊1個，國家產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位科學(xué)家2人，自治區(qū)級教壇新秀1人。

學(xué)院已形成學(xué)歷層次、職稱、年齡結(jié)構(gòu)合理而穩(wěn)定的師資隊伍。目前承擔(dān)著國家自然基金項目、國家863、973 、科技支撐計劃項目、公益性行業(yè)（農(nóng)業(yè)）科研專項經(jīng)費項目、國家重點研發(fā)計劃等共計 80 余項，與中國科學(xué)院、中國農(nóng)科院、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)等科研院所有著密切的科研合作關(guān)系，并與美國、日本、德國、荷蘭、西班牙等國相關(guān)科研院所建立了良好的合作關(guān)系。

學(xué)院秉承教學(xué)、科研、生產(chǎn)、社會服務(wù)相結(jié)合模式，現(xiàn)已培養(yǎng)農(nóng)業(yè)科技人才4000多名，其中有杰出的中國科學(xué)院院士康樂院士以及全國科研院所大專院校的學(xué)者專家和各行各業(yè)杰出的帶頭人管理者，遍及全國各地、為國家及自治區(qū)經(jīng)濟社會發(fā)展做出了巨大貢獻。