中國科學技術大學研究生院科學島分院（即中國科學院合肥物質科學研究院，簡稱合肥研究院）是中國科學院重要的科教基地之一，位于合肥市西郊風景秀麗的蜀山湖畔，現建設有安徽光學精密機械研究所、等離子體物理研究所、固體物理研究所、合肥智能機械研究所、強磁場科學中心、技術生物與農業工程研究所、先進制造技術研究所、醫學物理與技術中心、核能安全技術研究所和應用技術研究所、合肥研究院創新工程院等11個研究單元，擁有1個國家工程中心，1個國家工程實驗室，17個省部級重點實驗室/工程中心，以及全超導托卡馬克東方超環EAST、EAST輔助加熱、穩態強磁場等三個大科學工程，已成為中國科學院重要的科技創新基地、高技術發展基地和人才培養基地。江澤民總書記1998年蒞臨視察時高度評價合肥研究院的科研環境，欣然題詞“科學島”。

　　合肥研究院定位在面向國家潔凈能源與環境安全需求，面向極端與復雜條件下物質科學前沿，建設依托全超導托卡馬克、強磁場、大氣環境立體探測研究網等大科學裝置群的綜合性國家科研基地，形成等離子體物理、大氣環境光物理/化學、極端和復雜環境下材料與生物物理等優勢學科群，發展磁約束聚變堆、大氣環境探測、強磁場及能源環境健康等需求的功能材料與智能系統等戰略高技術。

　　截至2015年底，合肥研究院在職職工2497人，其中正高級人員304人，副高級人員648人，包括包括兩院院士5人，國家“萬人計劃”入選者4人、國家“千人計劃”入選者16人、科技部“創新人才推進計劃”5人、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選6人、國家“863”計劃評審專家5人、國家“973”計劃項目首席專家26人、國家杰出青年基金/優秀青年基金獲得者8人、中科院“百人計劃”入選者54人；國家基金委、中科院創新團隊8個，安徽省115團隊5個。

　　自1981年招收研究生，合肥研究院已培養研究生4927名，其中授予博士學位1977名，授予碩士學位2940名，他們已成為中國各個大學、科研機構以及企事業單位的骨干力量；目前在崗研究生導師469名，其中博導223名，碩導246名，在學研究生培養規模達到1500名，研究院現有學術型博士培養點12個；碩士培養點25個，涵蓋了等離子體物理、核科學與技術、環境科學與工程、材料科學與工程、光學工程、計算機與控制工程、生物物理學八大優勢學科，為基礎與應用型創新創業人才的培養建立了完備的學科體系。

　　十三五期間，合肥研究院將緊緊圍繞“一三五”發展目標，創新科研體制機制，促進學科交叉創新，集中加強基礎研究和行業共性核心技術研究，解決影響國家未來發展的重大科學和關鍵技術問題，加強加快高新技術應用和產業化工作，努力將我院建成國際著名、設施先進、規模效益明顯、創新能力強、開放程度高、科教結合的綜合科研基地。